L'histoire de la race remonte à l'époque des chevaux carrossiers et des animaux agricoles, en effet, le KWPN descend du Gelderland et du Groningue, deux races d'attelage également employées aux travaux des champs dans les Pays-Bas. Avec le temps et surtout la fin de l'utilisation agricole de ces chevaux, l'élevage s'est réorienté vers le sport de haut niveau. Les éleveurs hollandais se sont toujours adaptés au marché. Un élevage sélectif est entrepris, impliquant des croisements entre les chevaux de traction hollandais et le Pur Sang, ainsi que des races de sport françaises (Selle français) et allemandes. Le stud-book de la race est établi en 1958 et les performances des animaux leur valent d'être exportés dans différents pays.